Protein–RNA interactions for Protein: O70404

Vamp8, Vesicle-associated membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp8O70404 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Vamp8O70404 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp8O70404 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp8O70404 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp8O70404 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp8O70404 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp8O70404 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp8O70404 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp8O70404 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp8O70404 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp8O70404 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vamp8O70404 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms