Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xirp1O70373 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Xirp1O70373 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Xirp1O70373 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Xirp1O70373 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xirp1O70373 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xirp1O70373 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xirp1O70373 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xirp1O70373 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xirp1O70373 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xirp1O70373 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xirp1O70373 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xirp1O70373 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xirp1O70373 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xirp1O70373 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xirp1O70373 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xirp1O70373 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Xirp1O70373 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xirp1O70373 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xirp1O70373 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xirp1O70373 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xirp1O70373 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms