Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtssO70370 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtssO70370 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtssO70370 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtssO70370 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtssO70370 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtssO70370 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtssO70370 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CtssO70370 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtssO70370 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtssO70370 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtssO70370 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtssO70370 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtssO70370 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtssO70370 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtssO70370 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtssO70370 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtssO70370 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtssO70370 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtssO70370 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CtssO70370 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtssO70370 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtssO70370 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtssO70370 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtssO70370 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtssO70370 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtssO70370 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtssO70370 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtssO70370 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtssO70370 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtssO70370 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtssO70370 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CtssO70370 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtssO70370 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtssO70370 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtssO70370 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtssO70370 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtssO70370 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtssO70370 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtssO70370 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtssO70370 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtssO70370 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CtssO70370 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtssO70370 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtssO70370 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CtssO70370 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtssO70370 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CtssO70370 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CtssO70370 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CtssO70370 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CtssO70370 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtssO70370 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtssO70370 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CtssO70370 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtssO70370 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtssO70370 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtssO70370 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CtssO70370 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtssO70370 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CtssO70370 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CtssO70370 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtssO70370 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CtssO70370 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtssO70370 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtssO70370 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtssO70370 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CtssO70370 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtssO70370 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CtssO70370 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtssO70370 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtssO70370 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtssO70370 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtssO70370 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtssO70370 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtssO70370 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtssO70370 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtssO70370 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtssO70370 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtssO70370 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CtssO70370 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CtssO70370 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtssO70370 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtssO70370 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtssO70370 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtssO70370 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtssO70370 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtssO70370 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtssO70370 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtssO70370 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtssO70370 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtssO70370 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtssO70370 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtssO70370 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtssO70370 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtssO70370 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtssO70370 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtssO70370 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtssO70370 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtssO70370 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CtssO70370 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms