Protein–RNA interactions for Protein: O70152

Dpm1, Dolichol-phosphate mannosyltransferase subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpm1O70152 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dpm1O70152 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dpm1O70152 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dpm1O70152 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dpm1O70152 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dpm1O70152 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dpm1O70152 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dpm1O70152 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dpm1O70152 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dpm1O70152 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dpm1O70152 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dpm1O70152 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dpm1O70152 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dpm1O70152 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dpm1O70152 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dpm1O70152 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dpm1O70152 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms