Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ChkbO55229 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChkbO55229 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChkbO55229 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChkbO55229 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChkbO55229 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms