Protein–RNA interactions for Protein: O55128

Sap18, Histone deacetylase complex subunit SAP18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap18O55128 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sap18O55128 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap18O55128 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sap18O55128 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sap18O55128 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sap18O55128 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms