Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dsg2O55111 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms