Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Csnk2a2O54833 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csnk2a2O54833 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms