Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Limk2O54785 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Limk2O54785 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Limk2O54785 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Limk2O54785 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Limk2O54785 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Limk2O54785 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms