Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CrxO54751 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CrxO54751 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CrxO54751 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CrxO54751 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CrxO54751 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CrxO54751 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CrxO54751 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CrxO54751 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CrxO54751 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CrxO54751 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CrxO54751 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CrxO54751 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CrxO54751 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CrxO54751 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CrxO54751 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CrxO54751 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CrxO54751 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CrxO54751 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CrxO54751 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CrxO54751 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CrxO54751 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CrxO54751 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CrxO54751 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CrxO54751 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CrxO54751 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CrxO54751 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CrxO54751 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CrxO54751 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CrxO54751 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CrxO54751 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CrxO54751 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CrxO54751 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CrxO54751 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CrxO54751 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CrxO54751 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CrxO54751 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CrxO54751 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CrxO54751 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CrxO54751 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CrxO54751 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CrxO54751 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CrxO54751 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CrxO54751 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CrxO54751 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CrxO54751 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CrxO54751 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CrxO54751 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CrxO54751 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CrxO54751 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CrxO54751 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CrxO54751 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CrxO54751 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CrxO54751 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CrxO54751 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CrxO54751 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CrxO54751 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CrxO54751 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CrxO54751 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CrxO54751 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CrxO54751 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CrxO54751 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CrxO54751 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CrxO54751 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CrxO54751 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CrxO54751 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CrxO54751 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CrxO54751 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CrxO54751 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CrxO54751 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CrxO54751 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CrxO54751 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CrxO54751 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
CrxO54751 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CrxO54751 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CrxO54751 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CrxO54751 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
CrxO54751 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CrxO54751 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CrxO54751 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CrxO54751 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
CrxO54751 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CrxO54751 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CrxO54751 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CrxO54751 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CrxO54751 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CrxO54751 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CrxO54751 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CrxO54751 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CrxO54751 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CrxO54751 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CrxO54751 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CrxO54751 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CrxO54751 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CrxO54751 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CrxO54751 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CrxO54751 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CrxO54751 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CrxO54751 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CrxO54751 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms