Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gp1baO35930 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gp1baO35930 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms