Protein–RNA interactions for Protein: O35912

Emp3, Epithelial membrane protein 3, mousemouse

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Length 163 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emp3O35912 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emp3O35912 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Emp3O35912 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Emp3O35912 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emp3O35912 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emp3O35912 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emp3O35912 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emp3O35912 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emp3O35912 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms