Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp100O35892 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp100O35892 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Sp100O35892 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp100O35892 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp100O35892 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp100O35892 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Sp100O35892 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sp100O35892 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Sp100O35892 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sp100O35892 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sp100O35892 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sp100O35892 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sp100O35892 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sp100O35892 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sp100O35892 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sp100O35892 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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