Protein–RNA interactions for Protein: O35716

Socs1, Suppressor of cytokine signaling 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs1O35716 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Socs1O35716 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Socs1O35716 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Socs1O35716 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Socs1O35716 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Socs1O35716 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Socs1O35716 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Socs1O35716 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Socs1O35716 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Socs1O35716 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Socs1O35716 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Socs1O35716 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Socs1O35716 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Socs1O35716 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Socs1O35716 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Socs1O35716 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Socs1O35716 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Socs1O35716 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Socs1O35716 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Socs1O35716 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Socs1O35716 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Socs1O35716 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Socs1O35716 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Socs1O35716 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Socs1O35716 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Socs1O35716 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs1O35716 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs1O35716 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs1O35716 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Socs1O35716 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms