Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfrsf18O35714 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms