Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk4O35493 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk4O35493 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk4O35493 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clk4O35493 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clk4O35493 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clk4O35493 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clk4O35493 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clk4O35493 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clk4O35493 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clk4O35493 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clk4O35493 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clk4O35493 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clk4O35493 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clk4O35493 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clk4O35493 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clk4O35493 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clk4O35493 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clk4O35493 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clk4O35493 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clk4O35493 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clk4O35493 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk4O35493 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk4O35493 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk4O35493 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk4O35493 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk4O35493 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk4O35493 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk4O35493 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk4O35493 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk4O35493 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk4O35493 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk4O35493 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk4O35493 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk4O35493 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk4O35493 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk4O35493 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk4O35493 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clk4O35493 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms