Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccrl2O35457 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccrl2O35457 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms