Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kpna4O35343 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms