Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ptpn9O35239 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ptpn9O35239 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms