Protein–RNA interactions for Protein: O35216

Cenpa, Histone H3-like centromeric protein A, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpaO35216 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpaO35216 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CenpaO35216 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CenpaO35216 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CenpaO35216 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CenpaO35216 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CenpaO35216 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CenpaO35216 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms