Protein–RNA interactions for Protein: O35207

Cdk2ap1, Cyclin-dependent kinase 2-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk2ap1O35207 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk2ap1O35207 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk2ap1O35207 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk2ap1O35207 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk2ap1O35207 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk2ap1O35207 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk2ap1O35207 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk2ap1O35207 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk2ap1O35207 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk2ap1O35207 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk2ap1O35207 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk2ap1O35207 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk2ap1O35207 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk2ap1O35207 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cdk2ap1O35207 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk2ap1O35207 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk2ap1O35207 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk2ap1O35207 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk2ap1O35207 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms