Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ArxO35085 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ArxO35085 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ArxO35085 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ArxO35085 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ArxO35085 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ArxO35085 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ArxO35085 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ArxO35085 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ArxO35085 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ArxO35085 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ArxO35085 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ArxO35085 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ArxO35085 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ArxO35085 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ArxO35085 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ArxO35085 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ArxO35085 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ArxO35085 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ArxO35085 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ArxO35085 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ArxO35085 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ArxO35085 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ArxO35085 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ArxO35085 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ArxO35085 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ArxO35085 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ArxO35085 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ArxO35085 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ArxO35085 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ArxO35085 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ArxO35085 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ArxO35085 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ArxO35085 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ArxO35085 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ArxO35085 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ArxO35085 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ArxO35085 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ArxO35085 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ArxO35085 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ArxO35085 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ArxO35085 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ArxO35085 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ArxO35085 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ArxO35085 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ArxO35085 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ArxO35085 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ArxO35085 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ArxO35085 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ArxO35085 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ArxO35085 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ArxO35085 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ArxO35085 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ArxO35085 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ArxO35085 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ArxO35085 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ArxO35085 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ArxO35085 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ArxO35085 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ArxO35085 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ArxO35085 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ArxO35085 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ArxO35085 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ArxO35085 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ArxO35085 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ArxO35085 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ArxO35085 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ArxO35085 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ArxO35085 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ArxO35085 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ArxO35085 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ArxO35085 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ArxO35085 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ArxO35085 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ArxO35085 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ArxO35085 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ArxO35085 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ArxO35085 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ArxO35085 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ArxO35085 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ArxO35085 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ArxO35085 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ArxO35085 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ArxO35085 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ArxO35085 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ArxO35085 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ArxO35085 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ArxO35085 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ArxO35085 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ArxO35085 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ArxO35085 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ArxO35085 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ArxO35085 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ArxO35085 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ArxO35085 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ArxO35085 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ArxO35085 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ArxO35085 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ArxO35085 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ArxO35085 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms