Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cldn4O35054 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn4O35054 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms