Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Casq1O09165 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casq1O09165 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casq1O09165 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Casq1O09165 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Casq1O09165 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casq1O09165 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Casq1O09165 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Casq1O09165 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms