Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra2O08842 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra2O08842 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra2O08842 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra2O08842 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra2O08842 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfra2O08842 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gfra2O08842 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gfra2O08842 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gfra2O08842 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gfra2O08842 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms