Protein–RNA interactions for Protein: O08584

Klf6, Krueppel-like factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf6O08584 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf6O08584 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf6O08584 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Klf6O08584 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf6O08584 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf6O08584 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms