Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna5O08543 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efna5O08543 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efna5O08543 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efna5O08543 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna5O08543 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efna5O08543 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms