Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MsmbO08540 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MsmbO08540 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MsmbO08540 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
MsmbO08540 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MsmbO08540 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MsmbO08540 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MsmbO08540 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MsmbO08540 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MsmbO08540 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MsmbO08540 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MsmbO08540 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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