Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20939L7N243 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm20939L7N243 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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