Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
IfnabL7MTU6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
IfnabL7MTU6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms