Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm2056J3QQ02 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm2056J3QQ02 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms