Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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