Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Gm17577J3QNF7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Gm17577J3QNF7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm17577J3QNF7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
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