Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm20834J3QM72 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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