Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21060J3KMU4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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