Protein–RNA interactions for Protein: J3KMM7

A630095N17Rik, RIKEN cDNA A630095N17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A630095N17RikJ3KMM7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
A630095N17RikJ3KMM7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
A630095N17RikJ3KMM7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms