Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms