Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn1r12G5E8G1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r12G5E8G1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r12G5E8G1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r12G5E8G1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r12G5E8G1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r12G5E8G1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn1r12G5E8G1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms