Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nccrp1G3X9C2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nccrp1G3X9C2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms