Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Speer4cG3UXD1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Speer4cG3UXD1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms