Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r39G3UWE6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r39G3UWE6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms