Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ScaperF8VQ70 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ScaperF8VQ70 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ScaperF8VQ70 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ScaperF8VQ70 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ScaperF8VQ70 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ScaperF8VQ70 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ScaperF8VQ70 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ScaperF8VQ70 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ScaperF8VQ70 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ScaperF8VQ70 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ScaperF8VQ70 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ScaperF8VQ70 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ScaperF8VQ70 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ScaperF8VQ70 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ScaperF8VQ70 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ScaperF8VQ70 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ScaperF8VQ70 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ScaperF8VQ70 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ScaperF8VQ70 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ScaperF8VQ70 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ScaperF8VQ70 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ScaperF8VQ70 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ScaperF8VQ70 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ScaperF8VQ70 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ScaperF8VQ70 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ScaperF8VQ70 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ScaperF8VQ70 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ScaperF8VQ70 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ScaperF8VQ70 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms