Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Usp9yF8VPU6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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