Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LctF8VPT3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LctF8VPT3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LctF8VPT3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LctF8VPT3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LctF8VPT3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LctF8VPT3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LctF8VPT3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LctF8VPT3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LctF8VPT3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LctF8VPT3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LctF8VPT3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LctF8VPT3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LctF8VPT3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LctF8VPT3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LctF8VPT3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LctF8VPT3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LctF8VPT3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LctF8VPT3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LctF8VPT3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LctF8VPT3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LctF8VPT3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LctF8VPT3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LctF8VPT3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LctF8VPT3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LctF8VPT3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LctF8VPT3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LctF8VPT3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LctF8VPT3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LctF8VPT3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LctF8VPT3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LctF8VPT3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LctF8VPT3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LctF8VPT3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
LctF8VPT3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LctF8VPT3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LctF8VPT3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms