Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5160F8VPN3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5160F8VPN3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5160F8VPN3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5160F8VPN3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5160F8VPN3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5160F8VPN3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5160F8VPN3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5160F8VPN3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5160F8VPN3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5160F8VPN3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5160F8VPN3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5160F8VPN3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm5160F8VPN3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm5160F8VPN3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm5160F8VPN3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm5160F8VPN3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm5160F8VPN3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm5160F8VPN3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm5160F8VPN3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm5160F8VPN3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm5160F8VPN3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm5160F8VPN3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm5160F8VPN3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms