Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
D430041D05RikF6ZGR6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
D430041D05RikF6ZGR6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms