Protein–RNA interactions for Protein: F6Z6Z2

3110082J24Rik, RIKEN cDNA 3110082J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110082J24RikF6Z6Z2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
3110082J24RikF6Z6Z2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
3110082J24RikF6Z6Z2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
3110082J24RikF6Z6Z2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
3110082J24RikF6Z6Z2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
3110082J24RikF6Z6Z2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
3110082J24RikF6Z6Z2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
3110082J24RikF6Z6Z2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
3110082J24RikF6Z6Z2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
3110082J24RikF6Z6Z2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
3110082J24RikF6Z6Z2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
3110082J24RikF6Z6Z2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
3110082J24RikF6Z6Z2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
3110082J24RikF6Z6Z2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
3110082J24RikF6Z6Z2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
3110082J24RikF6Z6Z2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms