Protein–RNA interactions for Protein: F6VWU8

Zfp946, Zinc finger protein 946, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp946F6VWU8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zfp946F6VWU8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms