Protein–RNA interactions for Protein: F6URP1

Gm6619, Predicted gene 6619, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6619F6URP1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gm6619F6URP1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gm6619F6URP1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm6619F6URP1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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