Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf212F6TQD1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Rnf212F6TQD1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf212F6TQD1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Rnf212F6TQD1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf212F6TQD1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf212F6TQD1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf212F6TQD1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Rnf212F6TQD1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Rnf212F6TQD1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Rnf212F6TQD1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Rnf212F6TQD1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rnf212F6TQD1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rnf212F6TQD1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf212F6TQD1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf212F6TQD1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf212F6TQD1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf212F6TQD1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf212F6TQD1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rnf212F6TQD1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf212F6TQD1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf212F6TQD1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf212F6TQD1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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